【分子重ね合わせ法】
複数の活性化合物を、その物理化学的性質が一致するように三次元空間中で 重ね合わせることにより、標的蛋白質の結合部位の特徴を反映した「重ね合わせモデル」を作成します。

【SAR法】
「重ね合わせモデル」への各化合物の適合性の指標と活性 との重回帰分析に基づいて、化合物の構造と活性の関係を検討できます。活性未知の化合物についても、仮想受容体モデルへの適合性に基 づいて活性値を予測し、バーチャルスクリーニングを行えます。

【サイトモデル法】
データが少ない場合でも、「重ね合わせモデル」からユーザーの意向を反映した「サイトモデル」を作成し、バーチャルスクリーニングが行えます。